樱桃小丸子2ゾンビパンデミックにより崩壊した世界。記憶を失い見知らぬ場所で目覚めたミコトと、ここで暮らす彼女を保護した。　　蘭奈、莉莉、夕、史香、ムルムル、るみな6人の少女達。ある日、ミコトと共に保護された男が殺された。　　浮かび上がるミコトたちの抱える秘密。事件を追いながら芽生え始める友情。この事件の先には一体？