奇皇后3因为人为的过度开采，工业废料的随意丢弃，导致美丽海岛生态被破坏，变异怪物巨蛇攻击人类。主人公陈朗靠着自己的勇气带领众人逃生并牺牲性命保护家人。通过故事向人们发出了保护生态环境的预警，同时宣扬了团结、守护和爱的人性光辉。